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[2011년도-바이오과학정보과] 엑솜분석을 위한 단편서열의 효율적 조립프로그램 개발
  • 부서바이오과학정보과
  • 연구기관분자설계연구소
  • 연구자김창훈
  • 관련 검색어BWT, Seed Extension, Bowtie, Exome
  • 수정일2021.08.02
  • 조회수333
차세대 염기서열 해독 기술이 계속 발전함에 따라서, reference genome에 mapping해야 하는
read들의 길이가 점점 길어지고 있는 추세이므로, 이러한 작업을 효율적으로 수행할 수 있는 다양한
프로그램을 갖는 것은 매우 바람직한 일이다. 특히, BWT와 결합된 FM index를 활용하는 알고리듬
들은 훨씬 적은 메모리 요구량으로도 빠른 처리속도를 보여 주고 있지만, 현재까지 BWT/FM
index를 활용하면서도 길이가 긴 서열들을 효율적으로 mapping할 수 있는 프로그램은 BWA-SW뿐
이었기 때문에, BWT/FM index를 활용하되, BWA-SW와는 다른 방식으로 read를 mapping하는 방
법으로 정확도를 개선할 수 있는 방법을 찾아 볼 필요가 있다
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