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연구·사업

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참조유전체 데이터 공개 및 활용

한국인참조후성유전체 데이터 공개 (‘15.7. ~)

국내 : Korea Epigenome Project 홈페이지 (http://152.99.75.168/KEP/)

공개 데이터 종류

  • WGBS(Whlie Genome Bisulfite Sequencing)의 2차가공정보(bigBed, ‘15 ~)
  • mRNA의 2차가공정보(bigWig, ‘15 ~)
  • miRNA의 2차가공정보(bigWig, ‘15 ~)

국립보건연구원은 International Human Epigenome Consortium에 참여하여 50여종의 정보를 생산하여 컨소시엄에 기탁할 것을 약정하였습니다. 생산되는 정보로는 유전자발현량을 알 수 있는 mRNA sequencing, 유전자발현을 조절하는 whole genome bisulfite sequencing, miRNA sequencing, input과 6종의 antibody인 h3k27ac, h3k27me3, h3k36me3, h3k4me1, h3k4me3, h3k9me3에 대한 Chromatin Immuno Precipitation sequencing 데이터가 있습니다. 해당 10종의 데이터를 컨소시엄의 가이드라인에 따라 데이터를 정제하고 가공했으며, 총 57종의 가공된 데이터는 컨소시엄의 data portal을 통해 공개될 예정입니다.


국외 : IHEC 데이터 포털사이트(http://ihec-epigenomes.org)

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